呼吸与危重症医学科是国家临床药理研究基地，拥有1个病区，开设床位30张，RICU 4张，拥有专家团队12人，其中主任医师3人，副主任医师5人，主治医师4人；拥有博士生导师1人，南京医科大学康达学院副教授1人，博士5人（2人在读），硕士4人。学科囊括肺癌及介入、感染、慢性气道炎症（哮喘和慢性阻塞性肺病）、呼吸危重症、睡眠相关呼吸疾病及间质性肺病等多个亚专科，并具备相应的人才储备。

科室拥有先进设备：奥林巴斯电子支气管镜、肺功能仪、呼出气一氧化氮检测仪、德国万曼多导睡眠监测仪、多台经鼻高流量治疗仪、飞利浦V60无创呼吸机和有创呼吸机。

临床常见病、疑难危重病和优势技术：1、学科在诊治呼吸系统常见病如不明原因发热、肺部感染、慢性阻塞性肺疾病、哮喘、肺癌、肺心病、呼吸衰竭、胸腔积液、肺栓塞及睡眠呼吸障碍疾病等常见病方面积累了丰富的经验，对于一些呼吸系疑难杂症如特发性肺纤维化、肺结节病、肺毛霉菌、隐源性机化性肺炎、弥漫性泛细支气管炎、肺淋巴管肌瘤病及肺泡蛋白沉积症等少见病也有较丰富经验。2、呼吸科重症监护病房（RICU）：拥有多台无创和有创呼吸机、监护设备，对复杂性难治性感染、重症肺炎、急性间质性肺炎、感染性休克、大咯血介入治疗、大面积肺栓塞介入治疗等急危重病症的救治水平高。 3、科室常规开展无痛支气管镜，广泛应用于经支气管镜活检、肺泡灌洗、钳取肺内异物，经支气管镜高频电凝切、氩气、金属支架、硅酮支架植入等，用于治疗复杂气道良恶性肿瘤、食管气管瘘等等。

学科在肺部耐药菌感染、肺癌精准治疗、流感病毒新型药物研发等基础及临床研究有一定的成绩。近三年来科室完成GCP临床研究10余项，其中参加钟南山院士牵头的抗甲流新药全国多中心三期临床研究，疗效显著，入组数全国第一，相关文章作为共一作者发表在柳叶刀杂志。近年来科室多名博士作为主要完成人参与国家自然基金课题3项，主持南医大学校重点项目一项，在国内外医学杂志上发表中华核心期刊、SCI期刊10余篇，最高影响因子12.7分，参编学术专著和教材1部。其中干细胞治疗新冠肺炎的临床研究已被应用200次以上，其结论被写入专家共识。科室医生常年参与南京医科大学本科生和部分留学生呼吸系统理论教学和规培、实习、见习带教。